ایلخانان مغول ۱۰۴ سال در ایران حکومت کرده‌اند و در این مدت ۱۷ نفر فرمانروایی کرده است .
این موزه با شش بخش مراغه کهن، سفال، سکه، کتابت، فلز و شیشه یاد‌آور فرهنگ و تمدن مردم ایران در ۷۸۱ سال پیش است .
در بخش سفال موزه مراغه از تمام تکنیک‌های رایج سفالگری آن دوره که عصر طلایی سفالگری ایران نیز نام گرفته آثار بی‌نظیری به نمایش در آمده است.
کاسه، بشقاب، آبریز وانواع ظروف تزئینی از جمله سفال های به نمایش در آمده در این موزه است.
در بخش کتابت نیز صفحاتی از قرآن‌های نفیس به خط یاقوت مستعصمی به نمایش در آمده که برای اولین بار در این قرآن‌ها ترجمه فارسی زیر آیات نگاشته شده است.
مجموعه سکه‌های این موزه نیز شامل ۱۵۰ عدد سکه کامل‌ترین و ارزشمندترین سکه‌های دوره ایلخانان مغول بوده و از همه ایلخانانی که در ایران حکومت کرده‌اند، سکه‌های ارزشمندی به نمایش گذاشته است .
جنس این سکه ها از طلا ، نقر و مس که سکه های طلا برای اعیاد و جشن ها ، نقر برای تجار و بازرگانان و سکه های مس نیز برای دادوستد روزانه ضرب شده است .
در بخش مفرغ و شیشه این موزه آثارگرانبهایی از جمله انواع پیه سوز‌ها و ظروف پخت غذا از دوره ایلخانی به نمایش در آمده است .آثار به نمایش درآمده در این موزه از حفاری‌های محوطه‌های باستانی شهر‌های مختلف ایران شامل آذربایجان‌شرقی، گرگان، همدان، کاشان، خراسان و قزوین به دست آمده است.
در این موزه نزدیک به ۵۰۰ اثر تاریخی به نمایش در آمده است.
گفتنی است شهرستان مراغه با ۲۶۰ هزار نفر جمعیت در جنوب استان آذربایجان‌شرقی واقع است.
